تشخیص برهم‎کنش‎های مثبت کاذب در شبکه‎های برهم‎کنش پروتئین-پروتئین با استفاده از روش‎های محاسباتی

پروتئین‎ها هرگز به صورت منفرد عمل نمی‎کنند، بلکه از طریق برهم‎کنش با ‎دیگر پروتئین‎ها، عملکردهایشان را اجرا می‎کنند. بررسی این برهم‎کنش‎ها، پایه‎ای برای کشف مکانیسم‎های مولکولی، فرآیندها و مفاهیم زیستی مربوط به عملکردهای پروتئین‎ها می‎باشد. روش‎های آزمایشگاهی مقیاس بزرگ همانند mass spectrometry و yeast two-hybrid ، لیست وسیعی از برهم‎کنش‎های پروتئین- پروتئین را فراهم آورده‎اند، که این داده‎ها باعث افزایش قدرت تحقیقات و مطالعات حوزه‎ی پروتئوم شده است. مطالعات اخیر نشان داده است که برهم‎کنش‎های بدست آمده از روش‎های آزمایشگاهی حدودا دارای 50% خطای مثبت کاذب و منفی کاذب ‎می‎باشند. خطاهایی که در برهم‎کنش‎های پروتئین رخ داده است می‎تواند اکتشافات و تحقیقات را به سمت اشتباهی هدایت کند که هزینه‎ی بسیار گزافی دارد، به عنوان مثال اشتباه در تشخیص عامل بیماری‎زا در طراحی دارو که هزینه‎ی بسیار زیادی دارد، یکی از این اشتباهات می‎تواند می‎باشد. با توجه به مطالب ذکر شده، روشی برای شناسایی خطاهای مثبت کاذب بسیار ضروری می‎باشد.